Girêdanên hîdrojenê di navbera atomên N-H û C=O yên zincîra proteîn (protein)ê de çêdibin û avahiya duyemîn a proteînan pêk tînin: heliksên alfa û pelên beta. Avahiya sêyem jî bi rêya girêdanên hîdrojenê, hidrofobîk û kovalent (covalent)ê stabîl dibe.
